De mysterieuze James Griffin is door raadsels omgeven. Zo vraagt Michaela zich af of hij misschien een van hen is. En de passagiers ontdekken wat er kan gebeuren wanneer de aanwijzingen in verkeerde handen komen.
Michaela (Melissa Roxburgh) raakt gefascineerd door de mysterieuze James Griffin (Marc Menchaca), die dagenlang in een rivier heeft gedobberd en uiteindelijk is gered. Ze vraagt zich af of hij een van hen is. Met de seizoensfinale van
Manifest in zicht - hierna is er nog één aflevering te gaan - ontdekken de passagiers ook wat er kan gebeuren wanneer de aanwijzingen in verkeerde handen komen. Wanneer Michaela James eindelijk te spreken krijgt, vertelt hij haar dat ze breder moet denken dan ze tot nu toe heeft gedaan. In deze Amerikaanse serie dreigt een vliegtuig neer te storten na een turbulente vlucht. Uiteindelijk kunnen ze toch veilig landen. Op de grond blijkt dat de 191 passagiers al vijf jaar zijn vermist en dat iedereen denkt dat ze dood zijn.