Los Angeles is in de ban van een racistische groepering die gecoördineerde aanvallen uitvoert op middenstanders in de stad. Leden van de groep steken winkeleigenaars neer en stichten brand in hun winkels. In S.W.A.T. onderzoeken Hondo (Shemar Moore) en zijn team wie achter de aanvallen zitten, die zijn gericht op zwarte mensen.
Dat is nog knap lastig, aangezien het brein achter deze gewelddadigheden zelf niet actief aan de acties deelneemt en onzichtbaar blijft. Het team probeert er toch alles aan te doen om te voorkomen dat de groepering nog meer slachtoffers maakt. Deacon (Jay Harrington) en zijn vrouw Annie (Bre Blair) zijn het intussen niet met elkaar eens: Annie wil dat hun dochter Lila naar een privéschool gaat, maar Deacon voelt daar niets voor.