Na de breuk met Carly behandelt Shaun (Freddie Highmore) een Jane Doe die overlijdt zonder dat hij weet wat de oorzaak is. In The good doctor wil hij een autopsie uitvoeren om te ontdekken wat precies de overlijdensoorzaak was. Er is alleen een probleem: de identiteit van de vrouw is niet bekend, dus kan hij haar familie niet om toestemming vragen.
Antonia Thomas
Zijn obsessie met de autopsie doet zijn relaties binnen het ziekenhuis geen goed. Claire (Antonia Thomas) en Morgan (Fiona Gubelmann) buigen zich over een student die meerdere persoonlijkheden heeft. Tijdens de behandeling komen ze voor een mysterie te staan. De regie van deze aflevering is in handen van hoofdrolspeler Freddie Highmore. Voor de serie nam hij al meerdere keren op de regisseursstoel plaats.